Маленький скриптец для удаления всех таблиц из БД:
mysql -u user -ppassword db_name -e "show tables"\
| grep -v Tables_in | grep -v "+" \
| gawk '{print "drop table " $1 ";"}' \
| mysql -u user -ppassword db_name
Еще можно написать хранимую процедуру для этого, примерно так:
delimiter $$
DROP PROCEDURE IF exist drop_tables();
create procedure drop_tables()
begin
SELECT
@drop_sql:=concat('DROP TABLE IF EXISTS ', group_concat(table_name))
drop_statement
FROM information_schema.tables
WHERE table_schema=database();
IF (@drop_sql IS NOT NULL) THEN
PREPARE stmt from @drop_sql;
EXECUTE stmt;
DROP PREPARE stmt;
END IF;
end$$
delimiter ;
Вот так вот.